Pathway Coverage:

Candidatus Kinetoplastibacterium galatii TCC219
Chromosome: NC_020284
Plasmid/s: -
Total genes: 727
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PATRIC:
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PathwayCoverageCoverage in %missing enzymes
palmitate biosynthesis2/8254.2.1.59, 4.2.1.61, 2.3.1.41, 4.2.1.58, 3.1.2.21, 3.1.2.14
arachidonate biosynthesis2/9224.2.1.-, 1.14.19.2, 2.3.1.41, 1.14.19.6, 1.14.19.-, 6.2.1.3, 3.1.2.14
lipid metabolism8/47171.3.99.34, 1.3.1.101, 1.3.1.34, 1.1.1.35, 4.2.1.59, 5.1.2.3, 4.2.1.59 , 2.3.1.16, 1.3.99.3, 1.3.3.6, 3.1.1.23, 3.1.3.B14, 2.7.8.39, 2.7.8.38, 2.3.1.41, 3.1.1.-, 2.7.7.67, 2.7.8.5, 2.7.8.11, 2.7.8.8, 4.2.1.58, 2.1.1.79, 2.4.1.B51, 5.3.3.8, 4.2.1.17, 1.3.1.10, 2.5.1.42, 2.7.7.39, 3.1.1.79, 6.2.1.3, 2.4.1.B50, 3.1.2.14 , 2.5.1.41, 3.1.1.4, 1.1.1.261, 5.3.3.14, 3.1.1.3, 3.1.4.14, 2.3.1.38
cis-vaccenate biosynthesis2/4504.2.1.61, 3.1.2.14
purine metabolism21/69302.7.4.11, 2.7.1.76, 3.1.4.17, 3.5.2.-, 2.7.2.1, 3.5.4.2, 2.4.2.7, 3.5.4.4, 2.7.1.20, 3.2.2.7, 3.6.1.3, 4.6.1.1, 3.6.1.13, 3.5.4.8, 3.5.4.6, 1.2.99.2, 1.2.7.4, 4.1.2.4, 3.1.5.1, 1.2.1.2, 1.1.99.33, 6.3.4.23, 6.3.4.3, 4.3.1.4, 2.1.2.-, 2.1.2.4, 1.21.4.2, 1.7.1.7, 3.5.4.3, 3.5.4.15, 2.4.2.8, 3.5.4.10, 2.7.1.73, 3.2.2.2, 4.3.1.17, 1.5.1.5, 2.3.1.8, 5.4.2.7, 4.1.1.21, 2.1.2.3, 1.17.1.4 , 3.2.2.1, 2.4.2.1, 1.2.7.1, 1.17.4.-, 1.17.4.2, 1.17.1.4, 2.4.2.22
histidine metabolism12/32381.1.1.111, 3.5.2.-, 1.2.1.3, 1.4.3.22, 3.5.3.5, 3.5.3.8, 3.5.3.13, 4.3.1.4, 3.5.1.8, 2.1.2.5, 4.3.1.3, 4.1.1.22, 2.6.1.38, 3.1.3.15, ?.?.?/1.1.1.27?, 1.14.13.5, 3.5.2.7, 3.5.1.68, 2.6.1.58, 4.2.1.49
chorismate metabolism7/11642.2.1.10, 1.4.1.24, 2.2.1.11, 1.1.1.282
vitamin B6 metabolism4/8501.1.1.290, 1.2.1.72, 4.3.3.6, 2.7.1.35
isoprenid biosynthesis10/33302.5.1.10, 2.5.1.B14, 2.3.1.9, 2.5.1.85, 2.5.1.84, 4.1.1.33, 2.5.1.81, 2.7.1.B19, 1.3.1.83, 2.5.1.29, 2.7.4.B4, 2.5.1.30, 2.5.1.82, 1.1.1.88, 1.1.1.34, 1.1.1.B38, 2.3.3.10, 2.7.4.26, 5.3.3.2, 2.7.1.36, 2.7.4.2, 2.5.1.86, 2.5.1.89
geranylgeranyldiphosphate biosynthesis7/10702.7.1.B19, 2.5.1.29, 2.7.4.B4
L-lactaldehyde degradation1/3331.2.1.22, 1.1.1.77
lactate fermentation1/3331.1.2.3, 5.1.2.1
threonine metabolism6/17351.2.7.11, 1.2.1.10, 2.6.1.76, 2.3.1.29, 2.7.1.39, 2.3.1.31, 1.1.1.103, 4.1.2.5, 1.4.3.21, 2.7.2.15, 4.2.3.1
isoleucine metabolism5/11454.2.1.35, 2.3.1.182, 1.2.7.7, 2.6.1.42, 5.4.99.1, 6.2.1.17
leucine metabolism4/14291.2.7.7, 1.1.1.1, 2.6.1.42, 4.1.3.4, 1.3.8.4, 5.4.3.7, 1.4.1.9, 6.4.1.4, 4.2.1.18, 4.1.1.1
valine metabolism4/13311.3.99.12, 1.2.1.25, 1.1.1.31, 3.1.2.4, 1.1.1.1, 2.6.1.42, 4.2.1.17, 1.2.1.27, 4.1.1.1
CDP-diacylglycerol biosynthesis3/4752.7.7.41
glutathione metabolism4/13313.5.2.9, 1.8.1.13, 3.4.19.9, 2.3.2.4, 2.3.2.2, 2.5.1.18, 1.8.1.7, 6.3.1.8, 6.3.1.9
ubiquinone biosynthesis2/8252.2.2.-, 2.1.1.201 , 1.14.13.- , 2.5.1.39, 4.1.3.40, 2.1.1.61
phenylpropanoid biosynthesis2/11186.2.1.12, 1.14.13.36, 2.1.1.68, 2.1.1.104, 1.2.1.44, 1.1.1.195, 4.3.1.24, 2.3.1.133, 1.14.13.11
resorcinol degradation1/3331.13.11.37, 1.3.1.32
conversions6/41151.1.1.B4, 3.1.6.19, 3.8.1.2, 1.1.1.B3, 1.2.1.3, 1.1.1.359, 1.14.14.5, 3.2.1.177, 3.6.1.5, 1.20.4.1, 3.1.1.2, 6.2.1.25, 3.1.1.1, 1.11.1.6, 1.97.1.1, 1.13.11.49, 1.8.1.14, 3.6.1.11, 1.16.3.1, 3.2.1.70, 1.8.99.3, 1.13.11.73, 1.6.5.2, 1.6.3.B1, 1.6.3.B2, 1.11.1.1, 1.7.1.4, 3.6.1.19, 1.11.1.7, 1.18.1.4, 2.4.1.13, 1.15.1.2, 1.8.5.2, 2.8.1.1, 1.1.1.22
pyrimidine metabolism12/31393.5.4.5, 2.7.1.-, 3.5.4.1, 3.5.4.12, 3.5.4.30, 3.6.1.12, 4.1.2.4, 1.3.98.1, 1.3.5.2, 2.7.4.9, 5.4.2.7, 1.17.4.-, 3.2.2.8, 2.7.1.21, 2.4.2.4, 2.1.1.148, 2.4.2.9, 2.7.1.48, 2.4.2.3
photosynthesis8/19423.1.3.11 , 1.2.1.59, 1.2.1.13, 1.1.1.82, 1.1.1.40, 2.7.1.19, 1.97.1.12 , 2.7.9.1, 4.1.1.39, 4.1.2.-, 3.1.3.37
photosynthesis light reaction1/2501.97.1.12
glycolysis5/19262.7.1.11, 2.7.1.147, 2.7.1.146, 2.7.8.23, 2.7.1.90, 5.1.3.15, 5.3.1.9, 1.2.7.6, 1.2.1.9, 2.7.1.29, 2.7.1.1, 5.4.2.1, 5.4.2.12, 2.7.1.40
arginine metabolism8/33244.1.1.75, 3.5.1.16, 3.5.3.11, 3.5.3.12, 3.5.1.4, 3.5.3.1, 1.13.12.1, 3.5.3.6, 2.3.1.109, 2.6.1.84, 4.3.2.1, 2.7.2.2, 1.2.1.54, 2.7.2.11, 1.2.1.41, 3.5.3.7, 1.4.3.2, 2.1.3.9, 3.5.1.14, 3.5.1.53, 3.5.3.23, 4.3.1.12, 3.5.1.96, 1.2.1.71, 2.6.1.81
heme metabolism9/12752.3.1.37, 1.3.3.3, 1.3.3.4
acetyl-CoA biosynthesis (from pyruvate)2/3672.3.1.12
oxidative decarboxylation of pyruvate2/3672.3.1.12
vitamin B1 metabolism2/12173.5.99.2, 2.3.1.61, 2.7.1.50, 2.7.1.49, 2.7.4.7, 4.1.99.17 , 2.7.6.2, 2.7.1.89, 2.5.1.3, 2.7.4.16
tyrosine metabolism2/15134.1.1.80, 1.13.11.27, 1.2.3.13, 1.1.1.1, 1.3.1.43, 3.7.1.2, 2.6.1.79, 1.13.11.5, 5.2.1.2, 2.6.1.58, 4.1.1.25, 4.1.99.2, 2.6.1.5
sulfopterin metabolism3/6503.1.3.1, 3.5.1.10, 1.5.1.20
tetrahydrofolate metabolism8/17472.7.6.3, 6.3.3.2, 4.1.2.50, 4.3.99.3, 6.3.4.20, 4.1.3.38, 2.6.1.85, 3.5.1.10, 1.5.1.20
oxidative phosphorylation1/6171.9.3.1, 1.18.1.3, 1.10.3.10 , 3.6.1.15, 1.10.2.2
citric acid cycle2/21101.2.7.3, 2.8.3.5, 4.2.1.3, 4.1.3.6, 2.3.3.1, 4.1.3.34, 2.3.1.61, 4.2.1.2, 1.1.1.41, 1.1.1.42, 4.1.3.1, 1.1.1.37, 1.1.1.299, 2.3.3.9, 5.2.1.1, 4.1.1.3, 4.1.1.32, 1.3.99.1, 1.3.5.1
thioredoxin pathway1/1100
vitamin E metabolism1/2502.1.1.95
vitamin B12 metabolism2/2681.14.99.40, 3.1.3.73, 3.5.1.90, 2.7.1.156, 2.7.8.26, 2.7.7.62, 6.3.1.10, 6.3.5.10, 2.5.1.17, 1.16.8.1, 2.1.1.151, 2.1.1.196, 6.6.1.2, 6.3.5.9, 2.4.2.21, 2.1.1.130, 2.1.1.131, 1.14.13.83, 2.1.1.133, 1.3.1.54, 2.1.1.152, 2.1.1.132, 5.4.1.2, 4.99.1.3
methionine metabolism5/34154.1.1.80, 2.1.1.14, 1.13.11.54, 3.1.3.77, 3.3.1.1, 3.2.2.9, 1.1.1.1, 2.1.1.5, 4.1.1.72, 4.4.1.8, 2.5.1.48, 2.1.1.37, 2.1.1.10, 2.3.1.46, 4.1.1.74, 1.4.3.2, 4.4.1.11, 2.1.1.13, 3.2.2.16, 4.2.1.109, 2.5.1.43, 1.8.4.12, 4.1.1.43, 4.1.1.1, 2.5.1.B21, 2.7.1.100, 5.3.1.23, 4.4.1.21, 2.6.1.5
S-adenosyl-L-methionine cycle2/5402.1.1.14, 3.2.2.9, 4.4.1.21
glycine metabolism1/9111.1.3.15, 2.6.1.44, 1.4.3.3, 2.1.4.1, 1.4.2.1, 2.6.1.4, 2.1.1.2, 2.6.1.45
folate polyglutamylation1/3336.3.4.3, 6.3.2.17
pantothenate biosynthesis2/6331.1.1.169, 1.2.4.4, 6.3.2.36, 2.7.1.169
pentose phosphate pathway5/10503.1.1.31, 3.1.3.11 , 5.1.3.15, 1.1.1.49, 1.1.1.44
Calvin-Benson-Bassham cycle6/13463.1.3.11 , 1.2.1.59, 1.2.1.13, 2.7.1.19, 4.1.1.39, 4.1.2.-, 3.1.3.37
acetoin fermentation1/5201.1.1.4, 4.1.1.5, 1.1.1.303, 1.1.1.304
acetoin degradation1/5202.3.1.190, 4.1.1.5, 1.1.1.303, 1.1.1.304
benzoyl-CoA degradation1/6171.1.1.259, 1.1.1.-, 1.3.7.8, 3.7.1.-, 4.2.1.100
lipid A biosynthesis4/17242.4.99.14, 2.-.-.-, 1.1.1.2, 1.1.1.21, 2.4.-.-, 2.4.99.13 , 2.4.99.12, 2.4.1.44, 2.7.1.-, 2.4.1.58, 2.4.1.73, 3.5.1.108 , 2.4.1.58
KDO2-lipid A biosynthesis1/1100
lipid a core biosynthesis1/9112.4.99.14, 2.-.-.-, 2.4.-.-, 2.4.1.44, 2.7.1.-, 2.4.1.58, 2.4.1.73, 2.4.1.58
lysine metabolism5/41122.6.1.39, 1.17.1.8, 4.3.3.7, 3.5.1.30, 2.6.1.48, 1.5.1.21, 1.4.1.16, 4.2.1.52, 1.2.1.20, 1.3.99.7, 4.2.1.36, 2.3.3.14, 1.1.1.87, 1.1.1.286, 1.2.1.31, 2.6.1.36, 1.4.3.14, 1.5.3.7, 2.6.1.83, 5.4.3.2, 1.13.12.2, 1.4.1.18, 4.1.1.18, 2.3.1.32, 5.1.1.5, 4.2.1.114, 3.5.1.47, 2.6.1.-, 1.1.1.-, 1.5.1.9, 1.5.1.7, 1.5.1.10, 1.5.1.8, 1.2.1.31 , 2.6.1.17, 2.3.1.89
lipid a precursor biosynthesis3/4753.5.1.108
UDP-GlcNAc biosynthesis3/4752.7.7.23
dolichyl-diphosphooligosaccharide biosynthesis1/10102.4.1.142, 2.4.1.265, 2.4.1.261, 2.4.1.83, 2.4.1.117, 2.4.1.132, 2.4.1.131, 2.4.1.141, 2.7.8.15
peptidoglycan biosynthesis6/17355.1.1.3, 2.3.2.16, 2.3.2.17, 2.3.2.18, 2.4.1.129, 3.4.16.4, 2.5.1.7, 1.3.1.98, 6.3.2.13, 6.3.2.7, 6.3.2.10
tryptophan metabolism6/39153.5.99.5, 4.1.1.77, 4.2.1.80, 1.1.1.35, 1.13.11.6, 4.2.1.55, 4.1.3.39, 1.2.1.10, 2.3.1.9, 1.1.1.1, 1.1.1.71, 1.2.1.5, 4.1.1.45, 1.2.1.32, 4.1.1.28, 3.5.1.9, 4.2.1.17, 4.1.1.70, 1.2.3.7, 1.1.1.190, 1.1.1.110, 4.1.1.74, 1.2.7.8, 3.7.1.3, 1.14.13.9, 2.6.1.7, 1.5.1.- , 1.4.3.21, 1.13.99.3, 1.13.11.11, 2.6.1.27, 2.6.1.28, 4.1.99.1
trans-farnesyl-diphosphate biosynthesis1/2502.5.1.10
undecaprenyl diphosphate biosynthesis1/2502.5.1.89
carotenoid biosynthesis1/1381.3.5.5, 1.3.5.6, 1.14.13.129, 1.14.99.-, 1.14.99.45, 5.5.1.-, 5.5.1.19, 5.5.1.18, 5.2.1.13, 1.10.99.3, 1.14.13.90, 5.2.1.12
neurosporene biosynthesis1/1100
CMP-KDO biosynthesis3/4753.1.3.45
flavin biosynthesis3/16191.1.1.302, 3.5.1.102, 1.1.1.193, 2.5.1.78, 2.7.1.161, 3.5.4.26, 3.5.4.-, 2.7.7.2, 1.5.1.30, 3.5.4.25, 3.5.4.29, 3.1.3.-, 1.5.1.41
serine metabolism2/14143.1.3.38, 5.1.1.10, 4.3.1.18, 2.7.1.31, 1.1.1.29, 1.1.1.81, 4.3.1.17, 6.1.1.27, 1.1.1.95, 3.1.3.3, 5.1.1.18, 2.6.1.51
phenylalanine metabolism3/14214.2.1.96, 1.5.1.34, 1.1.1.1, 4.2.1.91, 5.4.99.5, 2.6.1.79, 1.2.1.39, 1.14.16.1, 5.1.1.11, 2.6.1.58, 4.1.1.43
NAD metabolism4/21193.2.2.5, 3.1.3.2, 1.4.1.21, 1.4.3.16, 1.6.1.2, 1.6.1.1, 2.4.2.30, 3.6.1.22, 6.3.1.5, 3.5.1.19, 2.7.7.1, 3.5.1.42, 6.3.4.21, 2.4.2.19, 3.2.2.14, 2.5.1.72, 2.7.1.22
NAD phosphorylation and dephosphorylation1/2501.6.1.2
coenzyme A metabolism3/5606.3.2.5, 4.1.1.36
lipoate biosynthesis1/4252.8.1.8, 2.3.1.181, 6.2.1.20
acyl carrier protein metabolism1/2503.1.4.14
gluconeogenesis2/9222.6.1.1, 3.1.3.11 , 1.1.1.38, 1.1.1.40, 4.1.1.3, 4.1.1.49, 4.1.1.32
alanine metabolism2/3563.1.2.4, 1.1.1.59, 2.6.1.19, 1.3.1.95, 1.3.99.3, 1.4.1.1, 5.1.1.1, 2.6.1.2, 1.2.1.3, 1.2.1.19, 4.1.1.11, 4.1.1.12, 5.1.1.13, 2.6.1.18, 3.5.1.6, 2.6.1.42, 1.4.99.1, 2.6.1.21, 1.4.3.1, 1.1.1.28, 2.6.1.41, 1.4.3.22, 3.5.2.2, 1.3.1.2, 4.2.1.17, 1.4.1.2, 2.8.3.-, 4.2.1.54, 1.5.3.-, 2.8.3.1, 6.2.1.17, 1.5.99.6, 2.6.1.66
molybdenum cofactor biosynthesis1/10104.1.99.18, 2.7.7.76, 2.7.7.77, 2.8.1.9, 2.7.7.75, 2.10.1.1, 2.8.1.12, 2.8.1.11, 2.7.7.80
vitamin K metabolism1/9112.5.1.74, 4.1.3.36, 2.2.1.9, 4.2.99.20, 2.1.1.163, 5.4.4.2, 4.2.1.113, 6.2.1.26
degradation of pentoses1/1385.3.1.3, 2.7.1.47, 1.2.1.21, 5.3.1.4, 4.1.2.17, 5.1.3.-, 5.1.3.22, 5.1.3.4, 2.7.1.53, 2.7.1.15, 5.4.99.-, 2.7.1.16
arabinose degradation1/5205.3.1.3, 2.7.1.47, 1.2.1.21, 4.1.2.17
myo-inositol biosynthesis1/4253.1.3.8, 1.1.1.18, 5.5.1.4
lipid biosynthesis1/1381.1.1.2, 1.1.1.21, 2.7.8.5, 2.7.8.11, 2.7.8.8, 4.1.1.33, 2.5.1.42, 1.1.1.177, 2.7.7.39, 2.5.1.41, 2.7.4.2, 1.1.1.261
cardiolipin biosynthesis1/3332.7.8.-, 2.7.8.5
starch degradation1/7143.2.1.1, 3.2.1.20, 3.2.1.2, 2.4.1.19, 3.2.1.54, 3.2.1.41
metabolism of disaccharids1/1761.1.1.-, 3.2.1.85, 3.2.1.28, 2.4.1.15, 3.2.1.22, 2.4.1.71, 3.2.1.26, 3.2.1.23, 2.7.1.4, 5.3.1.26, 1.1.99.13, 5.4.99.16, 3.2.1.48, 2.7.1.144, 4.1.2.40, 3.1.3.12
sucrose degradation1/6171.1.1.-, 2.4.1.71, 3.2.1.26, 1.1.99.13, 3.2.1.48
d-xylose degradation1/9114.2.1.43, 1.1.1.175, 1.1.1.179, 3.2.1.8, 3.2.1.37, 4.2.1.82, 3.1.1.68, 5.3.1.5
carnitine metabolism1/2502.1.1.43
gamma-glutamyl cycle1/4253.5.2.9, 2.3.2.4, 2.3.2.2
glutathione-mediated detoxification1/3333.4.19.9, 2.5.1.18
6-hydroxymethyl-dihydropterin diphosphate biosynthesis2/5402.7.6.3, 3.1.4.56, 3.5.4.39
allantoin degradation1/7143.5.3.-, 3.5.3.9, 3.5.2.5, 1.7.3.3, 3.5.2.17, 3.5.3.19
polyamine pathway2/2294.1.1.50, 3.5.3.11, 3.5.3.12, 4.1.1.96, 1.5.1.43, 2.3.1.57, 4.1.1.86, 1.2.1.-, 3.5.1.94, 6.3.1.11, 3.5.1.53, 1.5.3.13, 2.5.1.104, 3.5.3.24, 1.5.3.17, 4.1.1.17, 2.4.2.28, 2.5.1.16, 2.5.1.22, 2.5.1.23
C4 photosynthetic carbon assimilation1/4251.1.1.82, 1.1.1.40, 2.7.9.1
CAM-carbon fixation1/4251.1.1.37, 1.1.1.40, 2.7.9.1
phenol degradation1/1575.3.2.6, 1.2.1.85, 3.7.1.9, 4.1.1.77, 4.2.1.80, 4.1.1.61, 6.2.1.27, 1.3.7.9, 1.13.11.1, 1.13.11.2, 5.5.1.1, 5.3.3.4, 1.14.13.7, 1.14.13.1
cyanate degradation1/2504.2.1.104
selenocysteine biosynthesis1/6172.9.1.1, 2.9.1.2, 2.7.1.164, 2.7.9.3, 4.4.1.16
aspartate and asparagine metabolism1/1193.5.1.1, 6.3.5.4, 2.6.1.14, 6.1.1.22, 2.6.1.1, 6.3.1.1, 6.1.1.23, 3.5.1.38, 1.1.1.37, 3.5.1.3
proline metabolism1/1382.6.1.8, 3.5.3.6, 3.5.1.20, 1.5.99.13, 2.7.2.11, 1.2.1.41, 1.2.1.88, 2.6.1.13, 1.5.5.2, 5.1.1.4, 1.5.1.1, 1.5.1.2
cysteine metabolism1/1762.8.1.2, 5.1.1.10, 2.6.1.1, 4.2.1.22, 4.4.1.1, 1.13.11.20, 4.4.1.10, 2.5.1.47, 1.8.1.6, 4.4.1.15, 1.8.4.4, 4.4.1.25, 2.5.1.49, 2.5.1.65, 2.6.3.1, 2.3.1.30
propanol degradation1/7142.8.3.8, 6.4.1.6, 1.1.1.1, 1.2.1.3, 1.1.1.80, 2.8.3.1
acetate fermentation1/9112.7.2.1, 3.1.2.20, 3.6.1.7, 1.2.1.4, 2.3.1.8, 1.2.5.1, 1.2.1.-, 1.2.7.1
glutathione biosynthesis2/2100
biotin biosynthesis1/7142.3.1.47, 2.6.1.62, 6.3.4.14, 2.8.1.6, 6.3.4.15, 6.3.3.3
CO2 fixation in Crenarchaeota1/1574.2.1.55, 1.1.1.298, 4.2.1.116, 6.2.1.36, 4.2.1.120, 1.1.1.36, 2.3.1.9, 1.3.1.84, 1.2.1.75, 5.1.99.1, 5.4.99.2, 6.4.1.3, 1.2.1.76, 1.1.1.-