Pathway Coverage:

Parvibaculum lavamentivorans DS1
Chromosome: NC_009719
Plasmid/s: -
Total genes: 3636
Enzyme coding genes: 1180 [32% of genome]
Relevance-CutOff:
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PATRIC:
PathwayCoverageCoverage in %missing enzymes
PathwayCoverageCoverage in %missing enzymes
metabolism of disaccharids8/17473.2.1.85, 3.2.1.28, 2.4.1.71, 3.2.1.26, 5.3.1.26, 1.1.99.13, 3.2.1.48, 2.7.1.144, 4.1.2.40
sucrose degradation2/6332.4.1.71, 3.2.1.26, 1.1.99.13, 3.2.1.48
benzoyl-CoA degradation2/6331.1.1.259, 1.3.7.8, 3.7.1.-, 4.2.1.100
degradation of sugar alcohols6/15401.1.1.11, 1.1.1.9, 1.1.1.251, 1.1.1.17, 1.1.1.56, 1.1.1.140, 2.7.1.144, 4.1.2.40, 2.7.1.17
L-sorbose degradation1/2501.1.1.140
lysine metabolism12/41292.6.1.39, 3.5.1.30, 2.6.1.48, 1.5.1.21, 1.4.1.16, 1.2.1.20, 4.2.1.36, 2.3.3.14, 1.1.1.87, 1.1.1.286, 1.2.1.31, 2.6.1.36, 1.4.3.14, 1.5.3.7, 2.6.1.83, 5.4.3.2, 1.13.12.2, 1.4.1.18, 4.1.1.18, 2.3.1.32, 5.1.1.5, 4.2.1.114, 3.5.1.47, 1.5.1.9, 1.5.1.7, 1.5.1.10, 1.5.1.8, 1.2.1.31 , 2.3.1.89
CO2 fixation in Crenarchaeota8/15531.1.1.298, 4.2.1.116, 6.2.1.36, 4.2.1.120, 1.3.1.84, 1.2.1.75, 1.2.1.76
propanol degradation3/7432.8.3.8, 6.4.1.6, 1.1.1.80, 2.8.3.1
leucine metabolism9/14641.2.7.7, 5.4.3.7, 1.4.1.9, 4.2.1.18, 4.1.1.1
tryptophan metabolism11/39283.5.99.5, 4.1.1.77, 4.2.1.80, 1.13.11.6, 4.1.3.39, 1.2.1.10, 1.1.1.71, 1.2.1.5, 4.1.1.45, 1.2.1.32, 4.1.1.28, 3.5.1.9, 4.1.1.70, 1.2.3.7, 1.1.1.190, 1.1.1.110, 4.1.1.74, 1.2.7.8, 3.7.1.3, 1.14.13.9, 2.6.1.7, 1.5.1.- , 1.4.3.21, 1.13.99.3, 1.13.11.11, 2.6.1.27, 2.6.1.28, 4.1.99.1
tyrosine metabolism6/15404.1.1.80, 1.13.11.27, 1.2.3.13, 2.6.1.79, 1.13.11.5, 2.6.1.58, 4.1.1.25, 4.1.99.2, 2.6.1.5
phenylalanine metabolism7/14501.5.1.34, 2.6.1.79, 1.2.1.39, 1.14.16.1, 5.1.1.11, 2.6.1.58, 4.1.1.43
methionine metabolism17/34504.1.1.80, 3.2.2.9, 2.1.1.5, 4.1.1.72, 2.1.1.37, 2.1.1.10, 2.3.1.46, 4.1.1.74, 1.4.3.2, 3.2.2.16, 2.5.1.43, 4.1.1.43, 4.1.1.1, 2.5.1.B21, 2.7.1.100, 4.4.1.21, 2.6.1.5
valine metabolism11/13851.2.1.25, 4.1.1.1
ethanol fermentation1/4251.2.1.10, 2.3.1.54, 4.1.1.1
palmitate biosynthesis4/8504.2.1.61, 4.2.1.58, 3.1.2.21, 3.1.2.14
arachidonate biosynthesis6/9671.14.19.2, 1.14.19.6, 3.1.2.14
lipid metabolism22/47471.3.99.34, 1.3.1.101, 4.2.1.59 , 1.3.3.6, 3.1.1.23, 3.1.3.B14, 2.7.8.39, 2.7.8.38, 2.7.7.67, 2.7.8.11, 4.2.1.58, 2.4.1.B51, 5.3.3.8, 2.5.1.42, 2.7.7.39, 3.1.1.79, 2.4.1.B50, 3.1.2.14 , 2.5.1.41, 3.1.1.4, 1.1.1.261, 5.3.3.14, 3.1.1.3, 3.1.4.14, 2.3.1.38
cis-vaccenate biosynthesis2/4504.2.1.61, 3.1.2.14
sorbitol degradation1/1100
butanoate fermentation5/8632.7.2.7, 1.3.8.1, 2.3.1.B4
flavin biosynthesis10/16631.1.1.302, 3.5.1.102, 2.7.1.161, 1.5.1.30, 3.5.4.29, 1.5.1.41
purine metabolism32/69462.7.4.11, 2.7.1.76, 3.1.4.17, 3.5.2.-, 3.5.4.2, 3.5.4.4, 2.7.1.20, 3.2.2.7, 3.6.1.3, 3.5.4.8, 3.5.4.6, 3.2.2.4, 3.6.1.41, 1.2.7.4, 4.1.2.4, 1.2.1.2, 1.1.99.33, 6.3.4.23, 6.3.4.3, 4.3.1.4, 2.1.2.4, 1.21.4.2, 1.7.1.7, 3.5.4.3, 3.5.4.15, 2.7.1.73, 3.2.2.2, 4.3.1.17, 5.4.2.7, 1.17.1.4 , 3.2.2.1, 2.4.2.1, 1.2.7.1, 1.17.4.-, 1.17.4.2, 1.17.1.4, 2.4.2.22
conversions17/41411.1.1.B4, 3.1.6.19, 1.1.1.B3, 1.1.1.359, 1.14.14.5, 3.2.1.177, 3.6.1.5, 6.2.1.25, 3.1.1.1, 1.97.1.1, 1.13.11.49, 1.8.1.14, 3.2.1.70, 1.8.99.3, 1.13.11.73, 1.6.5.2, 1.6.3.B1, 1.6.3.B2, 1.11.1.1, 1.7.1.4, 1.18.1.4, 2.4.1.13, 1.15.1.2, 1.8.5.2
histidine metabolism16/32501.1.1.111, 3.5.2.-, 1.4.3.22, 3.5.3.5, 3.5.3.8, 3.5.3.13, 4.3.1.4, 3.5.1.8, 2.1.2.5, 4.1.1.22, 2.6.1.38, ?.?.?/1.1.1.27?, 1.14.13.5, 3.5.2.7, 2.6.1.58, 4.2.1.49
chorismate metabolism7/11642.2.1.10, 1.4.1.24, 2.2.1.11, 1.1.1.282
glycolate and glyoxylate degradation2/7293.1.3.85, 2.4.1.266, 2.7.1.31, 1.1.99.14, 4.1.1.47
vitamin B6 metabolism4/8501.1.1.290, 1.2.1.72, 4.3.3.6, 2.7.1.35
isoprenid biosynthesis14/33422.5.1.B14, 2.5.1.85, 2.5.1.84, 4.1.1.33, 2.5.1.81, 2.7.1.B19, 1.3.1.83, 2.7.4.B4, 2.5.1.30, 2.5.1.82, 1.1.1.88, 1.1.1.34, 1.1.1.B38, 2.7.4.26, 5.3.3.2, 2.7.1.36, 2.7.4.2, 2.5.1.86, 2.5.1.89
geranylgeranyldiphosphate biosynthesis8/10802.7.1.B19, 2.7.4.B4
formaldehyde oxidation2/3674.4.1.22
threonine metabolism10/17591.2.7.11, 1.2.1.10, 2.6.1.76, 2.3.1.29, 1.1.1.103, 1.4.3.21, 2.7.2.15
adipate degradation4/4100
phenylacetat degradation (aerobic)1/4252.3.1.174, 1.14.13.- , 6.2.1.30
aspartate and asparagine metabolism5/11453.5.1.1, 2.6.1.14, 6.1.1.22, 6.3.1.1, 3.5.1.38, 3.5.1.3
citric acid cycle13/21621.2.7.3, 2.8.3.5, 1.1.1.41, 1.1.1.299, 5.2.1.1, 4.1.1.3, 4.1.1.32, 1.3.5.1
CAM-carbon fixation3/4754.1.1.31
C4-carbon fixation5/8632.6.1.2, 1.1.1.39, 1.1.1.82
acetoin fermentation2/5404.1.1.5, 1.1.1.303, 1.1.1.304
butanediol degradation1/1100
gluconeogenesis3/9333.1.3.11 , 1.1.1.38, 4.1.1.3, 4.1.1.32, 4.1.1.31, 2.7.9.2
photosynthesis12/19633.1.3.11 , 1.2.1.59, 1.1.1.82, 4.1.1.31, 2.7.1.19, 1.97.1.12 , 4.1.1.39
C4 photosynthetic carbon assimilation2/4501.1.1.82, 4.1.1.31
degradation of sugar acids2/18114.1.2.21, 4.1.2.B11, 2.7.1.58, 4.1.2.20, 2.7.1.178, 2.7.1.45, 4.2.1.7, 3.2.1.31, 1.1.1.57, 4.2.1.42, 4.2.1.6, 4.2.1.40, 4.2.1.140, 5.3.1.12, 4.2.1.8, 1.1.1.58
galactarate degradation2/4504.1.2.20, 4.2.1.42
ketogluconate metabolism1/6171.1.1.274, 1.1.1.215, 1.1.99.3, 2.7.1.12, 1.1.1.264
serine metabolism5/14363.1.3.38, 5.1.1.10, 4.3.1.18, 2.7.1.31, 1.1.1.29, 4.3.1.17, 6.1.1.27, 5.1.1.18, 2.6.1.51
isoleucine metabolism9/11821.2.7.7, 5.4.99.1
CDP-diacylglycerol biosynthesis4/4100
lactate fermentation1/3331.1.1.27, 5.1.2.1
methylglyoxal degradation3/4754.2.3.3
glycine metabolism2/9222.6.1.44, 1.4.3.3, 2.1.4.1, 1.4.2.1, 2.6.1.4, 2.1.1.2, 2.6.1.45
photorespiration1/1100
glycogen metabolism7/11643.2.1.33, 2.7.7.27, 2.4.1.1, 2.4.1.21
glucose and glucose-1-phosphate degradation1/1100
glycerol degradation4/4100
glycine betaine biosynthesis1/3331.2.1.8, 3.1.4.4
oxidative phosphorylation5/6831.10.3.10
glutathione metabolism8/13621.8.1.13, 3.4.19.9, 2.3.2.4, 6.3.1.8, 6.3.1.9
methane metabolism1/6171.1.3.13, 1.5.8.1, 2.1.1.21, 1.5.99.5, 1.5.8.2
methanol oxidation1/2501.1.3.13
arachidonic acid metabolism3/22141.1.1.232, 1.1.1.196, 1.13.11.31, 1.13.11.33, 1.13.11.34, 1.13.11.40, 1.1.1.184, 3.3.2.-, 3.3.2.7, 5.4.4.-, 4.4.1.20, 5.3.99.2, 5.3.99.3, 1.1.1.189, 1.14.99.1, 1.1.1.188, 5.3.99.4, 3.3.2.10, 1.14.14.1
taurine degradation1/2501.4.99.2
ubiquinone biosynthesis3/8382.2.2.-, 2.1.1.201 , 1.14.13.- , 4.1.3.40, 2.1.1.61
phenylpropanoid biosynthesis2/11186.2.1.12, 1.14.13.36, 2.1.1.68, 2.1.1.104, 1.2.1.44, 1.1.1.195, 4.3.1.24, 2.3.1.133, 1.14.13.11
resorcinol degradation1/3331.13.11.37, 1.3.1.32
cyclohexanol degradation2/5401.1.1.258, 1.2.1.63, 1.1.1.245
4-hydroxyphenylacetate degradation5/8631.13.11.15, 1.14.14.-, 5.3.3.10
phenylmercury acetate degradation1/2504.99.1.2
pyrimidine metabolism17/31553.5.4.5, 3.5.4.1, 3.5.4.12, 3.5.4.30, 3.6.1.12, 4.1.2.4, 5.4.2.7, 1.17.4.-, 3.2.2.8, 2.7.1.21, 2.1.1.148, 2.4.2.9, 2.7.1.48, 2.4.2.3
photosynthesis light reaction1/2501.97.1.12
glycolysis11/19582.7.1.147, 2.7.1.146, 2.7.1.90, 5.1.3.15, 1.2.7.6, 1.2.1.9, 2.7.1.29, 2.7.1.1
Calvin-Benson-Bassham cycle9/13693.1.3.11 , 1.2.1.59, 2.7.1.19, 4.1.1.39
glutamate and glutamine metabolism13/32414.2.1.34, 2.6.1.19, 2.8.3.8, 4.3.1.1, 4.1.3.22, 1.2.1.-, 2.8.3.12, 4.1.1.70, 4.1.1.15, 3.5.1.38, 3.5.1.2, 2.6.1.15, 1.1.99.2, 4.3.1.2, 5.4.99.1, 3.5.1.3, 1.3.8.1, 1.2.1.24, 1.2.1.79
acetyl CoA biosynthesis1/6176.2.1.13, 3.1.2.1, 2.8.3.3, 1.2.1.15, 4.1.1.9
alanine metabolism16/35461.1.1.59, 2.6.1.19, 1.3.1.95, 2.6.1.2, 4.1.1.11, 5.1.1.13, 3.5.1.6, 1.4.3.1, 1.1.1.28, 2.6.1.41, 1.4.3.22, 3.5.2.2, 1.3.1.2, 2.8.3.-, 4.2.1.54, 1.5.3.-, 2.8.3.1, 1.5.99.6, 2.6.1.66
putrescine degradation1/1100
octane oxidation2/5401.14.15.3, 1.1.99.-, 1.18.1.1
Entner Doudoroff pathway2/14144.1.2.51, 4.1.2.14, 1.2.7.5, 5.1.3.3, 4.2.1.39, 1.1.1.118, 1.1.1.119, 1.1.1.47, 1.1.1.360, 1.2.99.8, 2.7.1.165, 4.2.1.12
arginine metabolism16/33484.1.1.75, 3.5.3.11, 3.5.3.1, 1.13.12.1, 3.5.3.6, 2.3.1.109, 2.6.1.84, 1.2.1.54, 3.5.3.7, 1.4.3.2, 2.1.3.9, 3.5.1.14, 3.5.3.23, 4.3.1.12, 3.5.1.96, 1.2.1.71, 2.6.1.81
proline metabolism4/13312.6.1.8, 3.5.3.6, 3.5.1.20, 1.5.99.13, 1.2.1.88, 2.6.1.13, 1.5.5.2, 5.1.1.4, 1.5.1.1
acetyl-CoA biosynthesis (from pyruvate)3/3100
oxidative decarboxylation of pyruvate3/3100
vitamin B1 metabolism7/12583.5.99.2, 2.7.1.50, 4.1.99.17 , 2.7.6.2, 2.7.1.89
arsenate detoxification1/1100
3-phenylpropionate and 3-(3-hydroxyphenyl)propionate degradation to 2-oxopent-4-enoate1/5203.7.1.-, 1.14.13.127 , 1.13.11.16, 1.14.12.19
chlorophyll metabolism1/10102.5.1.62, 1.1.1.294, 1.14.13.122, 1.3.1.75, 1.17.7.2 , 6.6.1.1, 2.1.1.11, 1.14.13.81, 1.3.1.33
chlorophyll a biosynthesis1/2502.5.1.62
siroheme biosynthesis2/2100
peptidoglycan biosynthesis13/17762.3.2.16, 2.3.2.17, 2.3.2.18, 6.3.2.7
heme metabolism10/12831.2.1.70, 1.3.3.4
carnitine degradation3/6501.1.1.254, 1.1.1.108, 2.8.3.-
incomplete reductive TCA cycle1/1100
NAD metabolism9/21433.2.2.5, 3.1.3.2, 1.4.1.21, 1.6.1.1, 2.4.2.30, 6.3.5.1, 3.5.1.19, 2.7.7.1, 3.5.1.42, 6.3.4.21, 3.2.2.14, 2.7.1.22
sulfopterin metabolism5/6833.5.1.10
tetrahydrofolate metabolism15/17884.3.99.3, 3.5.1.10
NAD phosphorylation and dephosphorylation2/2100
denitrification2/3671.7.2.4
sulfate reduction4/16251.8.99.2, 1.8.4.9, 1.12.98.B1, 1.8.1.18, 2.7.7.5, 1.8.2.1, 1.8.3.1, 1.8.99.1, 1.8.7.1, 2.3.3.15, 1.13.11.18, 1.13.11.55
glutathione redox reactions1/1100
thioredoxin pathway1/1100
lipid A biosynthesis8/17471.1.1.2, 1.1.1.21, 2.4.-.-, 2.4.99.13 , 2.4.1.44, 2.4.1.58, 2.4.1.73, 3.5.1.108 , 2.4.1.58
lipid a core biosynthesis4/9442.4.-.-, 2.4.1.44, 2.4.1.58, 2.4.1.73, 2.4.1.58
vitamin E metabolism1/2502.1.1.95
vitamin B12 metabolism6/26231.14.99.40, 3.5.1.90, 2.7.1.156, 2.7.8.26, 2.7.7.62, 6.3.1.10, 6.3.5.10, 1.16.8.1, 2.1.1.151, 2.1.1.196, 6.3.5.9, 2.1.1.130, 2.1.1.131, 1.14.13.83, 2.1.1.133, 1.3.1.54, 2.1.1.152, 2.1.1.132, 5.4.1.2, 4.99.1.3
S-adenosyl-L-methionine cycle3/5603.2.2.9, 4.4.1.21
vitamin K metabolism3/9332.5.1.74, 2.2.1.9, 4.2.99.20, 5.4.4.2, 4.2.1.113, 6.2.1.26
cyclopropane fatty acid (CFA) biosynthesis1/1100
folate polyglutamylation2/3676.3.4.3
pantothenate biosynthesis2/6331.1.1.169, 1.2.4.4, 6.3.2.36, 2.7.1.169
urea cycle6/9673.5.3.1, 6.3.4.16, 3.5.1.5
molybdenum cofactor biosynthesis3/10304.1.99.18, 2.7.7.77, 2.8.1.9, 2.7.7.75, 2.8.1.12, 2.8.1.11, 2.7.7.80
pentose phosphate pathway5/10503.1.1.31, 3.1.3.11 , 5.1.3.15, 1.1.1.49, 1.1.1.44
acetoin degradation1/5202.3.1.190, 4.1.1.5, 1.1.1.303, 1.1.1.304
KDO2-lipid A biosynthesis1/1100
lipid a precursor biosynthesis3/4753.5.1.108
UDP-GlcNAc biosynthesis4/4100
lipoate biosynthesis2/4502.7.7.63, 6.2.1.20
cysteine metabolism7/17415.1.1.10, 4.2.1.22, 4.4.1.1, 1.13.11.20, 4.4.1.10, 1.8.1.6, 1.8.4.4, 4.4.1.25, 2.5.1.65, 2.6.3.1
biotin biosynthesis7/7100
acetate fermentation3/9333.1.2.20, 3.6.1.7, 1.2.1.4, 1.2.5.1, 1.2.1.-, 1.2.7.1
mevalonate metabolism2/8251.1.1.88, 1.1.1.34, 1.1.1.B38, 2.7.4.26, 5.3.3.2, 2.7.1.36
gamma-glutamyl cycle3/4752.3.2.4
glyoxylate2/2100
dolichyl-diphosphooligosaccharide biosynthesis1/10102.4.1.142, 2.4.1.265, 2.4.1.261, 2.4.1.83, 2.4.1.117, 2.4.1.132, 2.4.1.131, 2.4.1.141, 2.7.8.15
trehalose biosynthesis4/5803.2.1.68
glycogen biosynthesis1/3332.4.1.11, 2.4.1.186
teichoic acid biosynthesis2/5402.7.8.12, 2.7.7.39, 2.4.1.187
polyamine pathway9/22413.5.3.11, 4.1.1.96, 1.5.1.43, 2.3.1.57, 4.1.1.86, 1.2.1.-, 6.3.1.11, 1.5.3.13, 2.5.1.104, 3.5.3.24, 1.5.3.17, 2.5.1.22, 2.5.1.23
KDO transfer to lipid IVA1/2502.4.99.13
trans-farnesyl-diphosphate biosynthesis2/2100
glutathione-mediated detoxification2/3673.4.19.9
undecaprenyl diphosphate biosynthesis1/2502.5.1.89
carotenoid biosynthesis1/1381.3.5.5, 1.3.5.6, 1.14.13.129, 1.14.99.-, 1.14.99.45, 5.5.1.-, 5.5.1.19, 5.5.1.18, 5.2.1.13, 1.10.99.3, 1.14.13.90, 5.2.1.12
neurosporene biosynthesis1/1100
homocysteine biosynthesis1/1100
CMP-KDO biosynthesis3/4753.1.3.45
coenzyme M biosynthesis1/10103.1.3.71, 1.8.98.1, 2.8.4.1, 2.5.1.76, 1.1.1.272, 1.1.1.337, 1.12.98.3, 4.4.1.19, 4.1.1.79
degradation of pentoses3/13235.3.1.3, 2.7.1.47, 1.2.1.21, 5.3.1.4, 5.1.3.-, 5.1.3.22, 5.1.3.4, 2.7.1.53, 5.4.99.-, 2.7.1.16
ribose degradation1/2505.4.99.-
coenzyme A metabolism5/5100
fructose and mannose metabolism1/1100
degradation of hexoses7/15472.7.1.56, 3.2.1.51, 5.4.2.6, 5.3.1.25, 2.7.1.51, 5.3.1.14, 2.7.1.5, 4.1.2.19
galactose metabolism4/9443.2.1.85, 5.4.2.6, 5.3.1.26, 2.7.1.144, 4.1.2.40
ascorbate metabolism2/7294.1.1.85, 1.1.99.21, 5.1.3.22, 5.1.3.4, 1.1.99.32
6-hydroxymethyl-dihydropterin diphosphate biosynthesis3/5603.1.4.56, 3.5.4.39
ppGpp biosynthesis3/3100
d-mannose degradation5/8633.6.1.21, 3.2.1.24, 2.7.1.7
dTDPLrhamnose biosynthesis3/4751.1.1.133
sulfate reduction dissimilatory1/3331.8.99.2, 1.8.99.1
galactose degradation1/1100
UDP-glucose biosynthesis1/2505.4.2.5
cardiolipin biosynthesis3/3100
phosphinothricin tripeptide biosynthesis1/1100
lipid biosynthesis3/13231.1.1.2, 1.1.1.21, 2.7.8.11, 4.1.1.33, 2.5.1.42, 1.1.1.177, 2.7.7.39, 2.5.1.41, 2.7.4.2, 1.1.1.261
acyl carrier protein metabolism1/2503.1.4.14
phosphatidylethanolamine bioynthesis2/2100
triacylglycerol degradation1/4253.1.1.23, 3.1.1.79, 3.1.1.3
4-hydroxymandelate degradation1/1191.1.99.31, 5.5.1.2, 2.8.3.6, 4.1.1.44, 1.2.1.64, 1.14.13.2, 1.2.1.7, 4.1.1.7, 5.1.2.2, 1.13.11.3
protocatechuate degradation1/4255.5.1.2, 4.1.1.44, 1.13.11.3
3-chlorocatechol degradation1/4251.13.11.1, 5.5.1.7, 1.3.1.32
sphingosine metabolism1/5201.3.1.27, 3.5.1.23, 2.7.1.91, 4.1.2.27
arabinose degradation2/5405.3.1.3, 2.7.1.47, 1.2.1.21
myo-inositol biosynthesis1/4253.1.3.8, 1.1.1.18, 5.5.1.4
starch degradation3/7433.2.1.2, 2.4.1.19, 3.2.1.54, 3.2.1.41
d-xylose degradation1/9114.2.1.43, 1.1.1.175, 1.1.1.179, 3.2.1.8, 3.2.1.37, 4.2.1.82, 3.1.1.68, 5.3.1.5
melibiose degradation1/1100
lactose degradation1/1100
enterobactin biosynthesis1/3331.3.1.28, 5.4.4.2
carnitine metabolism1/2502.1.1.43
degradation of aromatic, nitrogen containing compounds2/9223.1.3.41, 3.5.5.7, 3.1.8.1, 3.8.1.8, 3.5.99.3, 3.5.99.4, 4.2.1.84
acrylonitrile degradation1/4253.5.5.7, 3.1.8.1, 4.2.1.84
IAA biosynthesis1/3334.2.1.84, 1.13.12.3
aldoxime degradation2/3674.2.1.84
urea degradation2/3673.5.1.5
creatinine degradation2/8253.5.3.3, 3.5.4.21, 1.5.99.2, 3.5.1.59, 1.5.99.1, 1.5.3.1
allantoin degradation1/7143.5.3.-, 3.5.3.9, 3.5.2.5, 1.7.3.3, 3.5.2.17, 3.5.3.19
fucose degradation1/4253.2.1.51, 5.3.1.25, 2.7.1.51
preQ0 biosynthesis2/3674.3.99.3
phenol degradation2/15135.3.2.6, 1.2.1.85, 3.7.1.9, 4.1.1.77, 4.2.1.80, 4.1.1.61, 6.2.1.27, 1.3.7.9, 1.13.11.1, 1.13.11.2, 5.3.3.4, 1.14.13.7, 1.14.13.1
propionate fermentation3/10304.2.1.79, 2.3.3.5, 4.2.1.99, 2.1.3.1, 4.1.1.41, 2.8.3.-, 1.3.5.1
2-methylcitrate cycle1/4254.2.1.79, 2.3.3.5, 4.2.1.99
L-carnitine biosynthesis1/4251.2.1.47, 1.14.11.1, 1.14.11.8
cyanate degradation1/2504.2.1.104
selenocysteine biosynthesis2/6332.9.1.1, 2.9.1.2, 2.7.1.164, 2.7.9.3
bile acid biosynthesis, neutral pathway1/1474.2.1.107, 6.2.1.28, 1.1.1.213, 1.14.13.95, 2.3.1.65, 6.2.1.7, 1.1.1.181, 1.14.13.15, 1.14.13.17, 3.5.1.24, 1.3.1.3, 1.17.99.-, 2.3.1.176
gentisate degradation1/3333.7.1.20, 1.13.11.4
trehalose degradation1/2503.2.1.28
catechol degradation1/3331.13.11.1, 5.3.3.4
ceramide biosynthesis1/4251.1.1.102, 2.3.1.50, 2.3.1.24
glutathione biosynthesis2/2100
biotin-carboxyl carrier protein assembly2/2100